1、上部循环过滤（上滤）
上滤是放置于水族箱上部，通过潜水泵将水抽入上滤槽内，水流通过过滤棉、生化棉、各种滤材后再由底部的出水管流回到水族箱内。
优点：价格低廉、结构简单、清洗和维护方便。
缺点：占用水族箱的上部空间、在一定程度上影响水族箱的美观度、内部空间有限放置滤材相对较少从而生化过滤效果一般。另外，由于上滤过水面积大会增加CO2的逃逸，因此不适于种植水草的水族箱。
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2、滴流式过滤（滴漏过滤）
滴流式过滤是个集成的过滤器，它将物理过滤与生物过滤合在一个过滤槽中，在此过滤槽中分成几层，（具体层数可以根据需要增减）过滤槽的上层为物理过滤室，主要放置有过滤棉、生化棉，下面几层分别放置生化球、藤棉、玻璃环、石英球、细菌屋等各种滤材。当水流通过时会增加与空气的接触面从而增加容氧量，为好氧性细菌提供最理想的生存环境。
优点：物理生化过滤完善、过滤效果较好。
缺点：同样占用水族箱的上部空间、在一定程度影响水族箱的美观、水流的声音相对较大。
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3、背滤及侧滤
背滤及侧滤是在鱼缸的背部或侧部用玻璃隔出一部分做过滤，其内部分成几小格用于放置滤材和循环泵，一边设有溢流口，当水泵把水从过滤部分抽向鱼缸时，鱼缸溢出的水通过溢流口流入过滤部分的第一格，在隔板的引导下流经各种滤材，水从最后一格通过水泵再次送入鱼缸形成循环。
优点：利用鱼缸的内部空间使鱼缸和过滤形成一个整体，不需另外利用其它缸外位置就可以完成较好的过滤流程。一些器材可以在侧滤/背滤放置，适当放置不影响鱼缸的正面视觉美感。
缺点：占用了鱼缸的部分空间，缸内的空间会减少、受鱼缸宽度或长度的限制，放置过滤材料也受限制、水分的蒸发会引起水泵所在间隔的水位较快降低，需要频繁补水。
背滤缸结构图
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侧滤分为半侧或全侧，下图为半侧全侧可参看背滤
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