底缸过滤
底缸过滤是利用一个放置于底柜的大型滤槽（称为底缸），通过管道与主缸连接，利用水泵来完成水的循环，滤槽根据尺寸及实际需要分为若干格，用来分别放置不同的滤材或器材，底缸过滤一般采用溢流的下水方式，在形式上分为三角溢流、方形溢流、圆形溢流、三重溢流管溢流、不打孔溢流等多种形式。
优点：物理生化过滤完美搭配、增大了整个系统的水体，更有利于保持水质的稳定。底缸空间较大可以放置更多的过滤材料。底缸有更多的空间可以放置各种器材，使主缸更整洁美观。换水等操作可以在底缸进行，有效减少对缸内生物造成的影响。
缺点：主缸水位不易调解、结构复杂，制作成本较高、下水调解不当容易产生噪音、容易造成底柜潮湿、水泵扬程变长功率也会相应增大，耗电量也会增加。
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外滤桶过滤
外滤桶式过滤是一种密闭的过滤形式，桶内部分为若干层，每层都可以放置不同的过滤材料，利用桶内或桶外的水泵使水族箱中的水不断流经桶内的各层滤材，从而达到循环过滤的目的。启动前一定要保证桶内及进出水管满水避免有空气积存。
优点：占用缸内空间较小、噪音较低、生化过滤效果好、安装较灵活多样、出水可以帮助造流。
缺点：物理过滤效果较弱、清洗启动较繁琐、进出水管道容易造成凌乱。
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外挂式过滤（瀑布过滤器）
外挂过滤器是一种挂在缸壁上使用的半封闭式过滤器，内部设有不同的滤材摆放区域，利用机身自带的水泵将水族箱内的水吸入过滤器内部并流经各种滤材，达到循环过滤的目的。
优点：价格低廉使用简便，在缸壁上挂好即可开始工作、不占用缸内空间、噪音相对较小。
缺点：由于受到自身体积和内部空间的限制，滤材的放置量比较有限、过滤效果一般不适宜用于大型鱼缸、带有拉筋的水族箱及成品缸可能无法使用、过水面积大容易造成CO2的逃逸，所以并不适合用于草缸、出水水位高度无法调节。
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