有了良好的金鱼品种，才能生育出优良的下一代，所以对亲鱼的选择，一点也不能马虎，当作亲鱼的金鱼，必须尽可能具备每个品种最理想的条件，像单臀鳍、尾鳍没有完全分裂开来、鳍条弯曲、身形象野生鲫鱼般的修长形、尾柄既直又长....等等的金鱼品种都是不好的特征，应该弃之不用。
理想的种鱼应该具备以下特点：身强力壮、体形适中、游姿正常、色彩艳丽....等特征的金鱼。至于年龄，两年或三年鱼是最理想的，不过也有些人在饲养一年就拿来当作种鱼。年纪太大的雄鱼较没有力气去追逐雌鱼。同样的雌鱼虽能产卵，却很难受精，也不合适作为种鱼的。
为了确定幼鱼的品系，最好是一雄一雌的交配，不过在专业的金鱼繁殖场中，为了增加金鱼的受精率，大多采用三公二母的方式来集体交配，如此一来，不仅可以增加受精机会，也可以集中处理卵，也不失为一个好的方法。
作为亲鱼的雄雌鱼，其身体不应相差悬殊，如果公小母大，那么细小的雄鱼就无法排出足够的精液让雌鱼的卵全部受精，相反，如果公大母小，那么身体瘦弱的雌鱼就可能会被粗壮的雄鱼弄伤。
