选择优良的亲本是人工繁殖的物质基础。如何选择亲鳖是决定山瑞鳖人工繁殖乃至养殖成败的关键问题之一，直接影响经济效益。
山瑞鳖亲本来源有二：野外捕捉所得；人工饲养的群体中挑选而得。野生山瑞鳖作亲本要求体重在1.5公斤以上。人工饲养的山瑞鳖作亲本则要求年龄在3龄以上。样本要求体质健壮、无病无伤。具体的鉴别方法是：外观体表无创伤，后缘革状皮肤厚而有皱纹且略带坚硬者为营养良好、体质健壮；头伸缩自如，将背翻转朝下，健壮个体会迅速翻过身来；将山瑞鳖放入水中，如行动活泼、反应敏捷并能迅速潜入水底者说明体质健壮。
亲本雌雄比例以3：1为好。雌雄鉴别方法为：雌山瑞鳖尾较短，不露出裙边，雄性尾较长，能自然伸出裙边外；雌山瑞鳖后肢间距较宽，雄性后肢间距较窄；雌山瑞鳖体形圆厚，雄性体形则长而薄。
