以铜绿微囊藻为例，其在PH值在8-9.5水体最宜生长，喜高磷、低氮、高温、强光和静水。繁殖方式为无性繁殖，主要繁殖方式以营养细胞分裂为主，因具有3个细胞分裂面，所以繁殖速度非常快，严重时能在短短3-5天覆盖水面50%以上。
微囊藻的危害
微囊藻虽然具有产氧能力强、消耗水中有机质功能，但其危害性更大。首先，微囊藻在生长过程中也会分泌一种抑制其他藻类生长的物质，从而更容易形成种群优势，全面抑制其它藻类的生长。第二，其在水面形成的薄膜能阻挡阳光，同时阻碍水体与空气的氧气交换，打破水体溶氧的自然循环过程；而且微囊藻夜间好氧量非常大，严重消耗水体溶氧。以上几个方面叠加一起，容易导致水体缺氧（特别是夜间），导致养殖动物浮头或翻塘。第三，蓝藻大量死亡过程会产生恶臭味，蓝藻死亡后产生的毒素是目前范围最广的一种毒素，而微囊藻死后产生的毒素LR是目前已知蓝藻中毒性最强，急性危害最大的一种毒素，其集中大量死亡产生的毒素会对水生动物会产生严重危害。同时，其死亡过程会严重消耗水体中的溶解氧，造成缺氧或转水，对水产养殖产生灾难性后果。
治疗措施
在水产养殖过程中，一旦发现水体中有微囊藻时，尽量及时处理，避免遭受更大损失。1、首先杀死微囊藻，然后加注新水，同时开动增氧机，使水体搅动。2、同时可使用解毒和降低PH值的制剂后，通过施肥培养有益单细胞藻类，让有益藻形成种群优势，从而压制微囊藻的生长和繁殖。这样就能起到很好的防治效果。
杀微囊藻药品市场现状
目前市场上有名目繁多的杀蓝藻药物，杀藻机理也不尽相同，总体来说实际效果不是很理想。而且要达到一定效果需要的药物浓度在不断提高，对水体的伤害也越来越大，我们杀死微囊藻的目的是为了促进水体形成新的有益藻种群优势，但是大多数药品没有选择性，连同有益藻也一并杀死，这样让水体生态变的更脆弱，对水产养殖带来很大的风险。 蓝藻门
同时，如果快速杀死微囊藻，其死亡产生的毒素以及起死亡时消耗大量的溶解氧会对养殖动物造成严重危害，有可能导致大面积死亡；如果不杀任其发展，其会迅速促使建立其种群优势，后果可能更为严重。
因此，我们在杀微囊藻时面临两难选择，很难兼顾。其实，最有效的办法只能是通过使其分批死亡，避免毒素集中释放造成的水产动物的应激反应，同时也起到了杀灭和抑制其生长繁殖的目的，为有益藻种群的生长繁殖提供更好的条件。
最新研究成果
北京中水华峰生物技术有限公司，通过几年的科研与实践，利用微囊藻细胞壁上有粘性缩氨肽以及其内部具有伪空泡的特点，研制出一种全新的微囊藻杀灭剂。它不含重金属成分，对养殖动物也没有危害，杀灭效果好但作用温和持久，杀微囊藻的同时避免了微囊藻集中死亡造成的缺氧和养殖动物中毒现象。实际使用案例：
2012年7月16日，北京平谷区马昌营镇梁昌发鱼池暴发了微囊藻，微囊藻占据水面达60%以上，池边散发出铜臭味，用手拨开水面，水体清瘦，手上沾满微囊藻，池边也能看到白鲢排出的绿色粪便，池塘中草鱼、鲤鱼不喜欢摄食。笔者询问情况，池主说这种情况已经有5天了，采用了一些办法但没有解决问题，而且微囊藻繁殖越来越多。开始微囊藻较少时没有注意，没想到短短一周时间就成了这样。笔者询问了他都用过什么药品，然后告诉他以下治疗方法，仅供大家参考。
先抽去20-30公分水，最好表层水，第二天使用“华峰蓝藻清”，1瓶2亩，均匀泼洒，在微囊藻集中地方可以多泼些。特别提醒他池塘边一定要泼到。第4天用“华峰池塘解毒灵”每瓶2亩，第5天加注新水或用其它鱼吃食好的池塘的池水20-30公分即可，在治疗期间，不能使用杀虫剂或消毒剂，同时多开增氧机。
养殖户用完“华峰蓝藻清”后第二天给笔者打电话，说效果不明显，问怎么回事。笔者告诉他这是正常情况，如果蓝藻集中大量死亡会有危险，容易造成中毒或缺氧造成转水，所以杀蓝藻药品就应该逐步起效，并告诉他发现水呈现黄绿色就可以了。又过了3天，养殖户给笔者来电话，说水色已经变了，的确有点变成黄绿色。然后笔者告诉他按原来的方案做就可以了。到了第六天，笔者再给梁昌发打电话，他很高兴的告诉笔者，鱼池已经没有了臭味，水呈黄绿色，微囊藻已经几乎没有了，鱼也开始正常吃食了。
这是治疗微囊藻的案例之一，作为多年从事鱼药行业，又在一线摸爬滚打多年的从业者，自己得出的感悟是：只有真正为养殖户解决实际问题，真正为老百姓着想，而不是把个人经济利益放在第一位，才会赢得老百姓的信赖，才能更好实现自己的职业价值，路也会越走越宽”。最后提醒下，使用“华峰蓝藻清”时，按使用说明规范操作，以确保取得好的治疗效果。
预防微囊藻的一些见解
1、 微囊藻暴发在池塘中的表象是水体变瘦，所以笔者根据自己经验总结，蓝藻暴发最主要的原因可能是氮磷的比例问题，比如当水体中氮磷含量都很高的时候，虽然是严重的富营养化，但是由于其他藻类的存在，一般不会形成蓝藻的爆发。因此，氮磷比失调可能是导致蓝藻开始滋生的重要原因。
2、在高温季节，水体中的磷如果含量过高，而氮比较缺乏，这时微囊藻就很容易迅速生长繁殖，短期内形成绝对性的种群优势。原因可能是水体氮元素不足以供应绿藻、硅藻、小球藻等藻类的生长需要，使这些藻类的生长繁殖受到限制。而微囊藻具有利用水体中N2的能力，所以其生长不受影响。
3、降低水体的PH值（使PH值在7-8之间为宜）来预防微囊藻的滋生。磷酸二氢钙长期使用会使池塘PH值升高，而使用尿素会降低池塘PH值，蓝藻比较容易发生在PH值高的水体。由此分析，蓝藻滋生的原因可能是水体磷元素含量过高而氮元素较低的缘故。因此，在微囊藻出现时，通过施用氮肥，一方面能降低水体PH值，同时能促进其它藻类的生长，改善水体藻类种群结构。
4、养殖池塘套养摄食浮游植物的鱼类（比如白鲢）。虽然浮游植物型鱼类很难消化污泥颤藻、直粒链藻等微囊藻，也不喜欢食用，但毕竟对微囊藻有一定的消耗作用，所以也还是预防的办法之一。
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