生态养殖的基本原理，就是保持养殖水体生态系统的生态平衡。生态系统由三大部分组成：生产者、消费者、分解者，生态系统的核心就是能量流动与物质循环。生产者：水草、藻类、青苔等，消费者：河蟹、小龙虾，对虾，虫子等，分解者：微生物。因此，生态养殖的基本原理就是保持养殖水体中生产者、消费者、分解者三者之间能量流动与物质循环的平衡。
传统的水产养殖
传统的水产养殖生产工艺是片面强调消费者，忽视分解者和生产者，所以造成其生态系统极其不平衡。
生产者——水生植物以藻类为主体，能量转化效率低下，造成水体富营养化。
消费者——水产养殖对象是整个生态系统的核心，数量多，投饵量大，产生大量的排泄物和残饵。
分解者——微生物的数量和种类少，经常处于超负荷状态。
传统的水产养殖存在的问题：
分解者少，大量的有机污染物无法及时分解，造成池底耗氧，水质恶化。
生产者效率低下，无法将水体中的营养盐全部转换吸收，导致有害物质积累，对养殖对象产生危害。
其结果造成生态系统的不平衡，引起水体富营养化，养殖对象生长缓慢，细菌病害严重，采取大量药物处理，水产品品质下降。
生态养殖的基本原理
生态养殖采取“促进生产者，改革消费者，强化分解者”的基本理念，保持生态系统的平衡。
促进生产者——栽培和保护水生植物（或高等藻类），通过光合作用，将营养盐转换吸收。
改革消费者——坚持“以水养渔，以渔净水”的观念，改革养殖模式，实施混养、稀养。
强化分解者——利用微生物制剂，使水体和底泥中的有益微生物数量增加，将大量的有机物分解成无机盐。
藻类和细菌构成了池塘系统的两个最为关键的基础。藻类和细菌既有相生作用，如藻类为细菌提供营养，细菌对有机物的矿化为藻类提供营养素；同时，两者又有相克作用，如藻类和细菌都需要某些微量元素，具有竞争关系。
因此，只有改善养殖的水环境、溶氧，有益微生物生长繁殖迅速，有机物分解快，营养盐类的利用率高，有害物质就不易大量积累，水体有害细菌就不易滋生。水质好，有机体新陈代谢快，对不良环境的抵抗力强，就不易患病。
产品不是万能的，防重于治。
坚持以双养理论为核心理念高效养殖。
